この庫裏は妙法寺が明治19年12月3日焼失のあと、同町船津の旧家井出與五右衛門家の居宅を譲り受け、明治20年6月に移築したもので、井出家に残る祈祷札、上段ノ間畳裏の墨書により文化15年（1818）建築されたものと推定される。

井出家は450余年の歴史をもち代々名主をつとめた当地方きっての名家であり、この建物は甲斐絹問屋をしていた頃建てられたもので、町家の構造をもった民家である。